O Jornal de Pesquisa e Prática Odontológica segue o processo de double blind peer review, cada manuscrito submetido é processado para verificação preliminar de controle de qualidade pela redação, seguido de processo de peer review externo. Normalmente, o controle de qualidade preliminar é concluído em sete dias e é principalmente com referência à formatação do periódico, padrões em inglês e relevância do artigo para o escopo do periódico.