Toxinas bacterianas são toxinas produzidas por microrganismos, incluindo bactérias e fungos. Essas toxinas promovem infecções e doenças, danificando diretamente os tecidos do hospedeiro e desativando o sistema imunológico. As toxinas bacterianas são exotoxinas e endotoxinas. As endotoxinas são substâncias associadas a células que são componentes estruturais de bactérias. A maioria das endotoxinas está localizada no envelope celular. As exotoxinas são geralmente secretadas por bactérias e atuam em um local removido do crescimento bacteriano.