As ferramentas de bioinformática são programas de software projetados para extrair informações significativas da massa de bancos de dados de biologia molecular/biológica e para realizar análises sequenciais ou estruturais. Existem softwares de mineração de dados que recuperam dados de bancos de dados de sequências genômicas e também ferramentas de visualização para analisar e recuperar informações de bancos de dados proteômicos. Estes podem ser classificados como ferramentas de homologia e similaridade, ferramentas de análise funcional de proteínas, ferramentas de análise de sequência e ferramentas diversas.
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