As modificações de RNA são atores emergentes no campo da regulação pós-transcricional da expressão gênica e estão atraindo um grau comparável de interesse de pesquisa para modificações de DNA e histonas no campo da epigenética. Agora sabemos de mais de 150 modificações de RNA e o verdadeiro potencial de algumas delas está emergindo como consequência de um salto na tecnologia de detecção, principalmente associada ao sequenciamento de alto rendimento. Esta revisão descreve os principais desenvolvimentos neste campo por meio de uma discussão estruturada dos princípios de detecção, apresenta as vantagens e desvantagens dos novos métodos de alto rendimento e apresenta a identificação biofísica convencional de modificações como formas significativas de validação.