Questões éticas, incluindo preocupações com o bem-estar animal, podem surgir em todos os estágios da geração e do ciclo de vida de um animal geneticamente modificado. As secções seguintes detalham algumas das questões que surgiram durante o processo de desenvolvimento de orientações pelos pares e consultas de análise de impacto associadas realizadas pelo CCAC. O CCAC trabalha com uma ética aceita de uso de animais na ciência. No entanto, apesar das medidas tomadas para minimizar a dor e o sofrimento, há evidências de preocupações públicas que vão além dos Três Rs e do bem-estar animal em relação à criação e uso de animais geneticamente modificados.
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