A genômica funcional é um campo da biologia molecular que tenta fazer uso da vasta riqueza de dados produzidos por projetos genômicos e transcriptômicos (como projetos de sequenciamento de genoma e RNA-seq) para descrever funções e interações de genes (e proteínas).
O objetivo dos estudos de genômica funcional é entender a complexa relação entre genótipo e fenótipo em uma escala global (genômica ampla). Estudos investigam uma série de processos, como transcrição, tradução e regulação epigenética.
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