O estudo de todos os aspectos das interações fúngicas entre organismos e sua dinâmica populacional ambiental; adaptação; evolução; papel no funcionamento do ecossistema, ciclagem de nutrientes, decomposição, alocação de carbono; Ecofisiologia; interações miceliais intra e interespecíficas, interação fungo-planta, fungo-invertebrado e fungo-micróbio; genômica e genética; a conservação e a biodiversidade estão incluídas na ecologia fúngica.
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