Métodos in silico com uso de bioinformática estão em demanda crescente na descoberta e desenvolvimento de drogas que podem identificar e analisar sítios ativos e sugerir potenciais moléculas de drogas que podem se ligar especificamente a esses sítios. Eles analisam as estruturas alvo para possíveis locais de ligação, geram moléculas candidatas, verificam sua semelhança com drogas, acoplam essas moléculas ao alvo, classificam-nas de acordo com suas afinidades de ligação, otimizam ainda mais as moléculas para melhorar as características de ligação.
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