Clarissa Érica
Os dados da sequenciação de RNA unicelular podem revelar a variedade molecular dos diferentes tipos de células. Publicações recentes de atlas de tipos de células para a medula espinal de ratinhos ainda não foram combinadas. Aqui, utilizando dados do transcriptoma unicelular, criámos um atlas de tipos de células espinhais, combinando os vários conjuntos de dados num único quadro de referência. Apresentamos uma estrutura hierárquica de interações de tipos celulares pós-natais, com a localização a servir como o mais alto nível de organização, seguida pelo estado do neurotransmissor, família e dezenas de populações refinadas. Mapeámos as distribuições geográficas de cada tipo de célula neuronal na medula espinal adulta e validámos um código marcador combinatório para cada uma. Também demonstrámos intrincadas ligações de linhagem entre vários tipos de células pós-natais. Para auxiliar na normalização da identificação do tipo de célula, criámos também o classificador de tipo de célula de código aberto SeqSeek. Uma compreensão integrada dos vários tipos de células espinhais, do seu arranjo molecular e dos seus perfis de expressão genética é fornecida por este trabalho.