Um conjunto típico de dados de expressão gênica registra o nível de expressão de cada gene em uma amostra biológica. A análise comum desses dados envolve (demonstrar que muitos genes são expressos diferencialmente na amostra, ou seja, a condição biológica tem uma “assinatura transcriptômica” que é então explorada mais a fundo, caracterizando os genes expressos diferencialmente (DEGs) que formam a assinatura transcriptômica, e inferir componentes das redes reguladoras da transcrição (TRNs) que são responsáveis pela assinatura transcriptômica observada.
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