Uma técnica química analítica que é usada para determinar a quantidade de proteínas na amostra dada é por proteômica quantitativa. A análise global da expressão de proteínas está sendo cada vez mais usada como um método para estudar alterações induzidas por perturbações e estados estacionários em perfis de proteínas. As diferenças na expressão de proteínas entre diferentes estados biológicos da célula, ou seja, controle versus tratamento, saudável versus doença, genótipo específico versus tipo selvagem. Biomarcadores candidatos foram descobertos específicos para o modelo de antraz murino para comparar a resposta de cepas toxigênicas e não toxigênicas. A análise proteômica de fluidos corporais é um obstáculo devido à presença de proteínas abundantes que interferem nas tecnologias de perfilamento de proteoma, como SELDI, com resolução e sensibilidade.
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